Основне використання систем синхронізації часу є досягнення єдиного часу для всіх пристроїв в мережі. Найбільш актуальним таке використання є в локальних мережах спеціального призначення, де можуть використовуватись різні системи захисту інформації або обробки даних.

В якості найбільш росповсюджених прикладів можна навести лабораторні комплекси в яких виконується обробка даних в режимі реального часу. В цьому випадку синхронізація потрібна для корректної обробки даних.

Важливим прикладом є мережі банківських транзакцій, які використовують мітки часу (timestamp). Ці мітки можуть бути використані на приймаючій стороні для аналізу часу передачі даних та вирішити валідність отриманих даних. Така процедура надає додатковий шар захисту данних, але потребує точної синхронізації між сторонами прийому та передачі.

Ще один важливий приклад використання серверів точного часу – це телекомунікаційні системи. Точний час є критичним для аналізу продуктивності мережі та аналізу якісних характеристик мережі.